ApE- Ein Plasmid-Editor
Für alle Mac-Nutzer: Das verursacht Mac Fehler ein Flimmern hängen, wenn mehrere Dateien öffnen sollte in dieser neuesten Version (2.0.51) festgelegt werden. Lassen Sie uns wissen, wenn Sie irgendwelche Probleme zu finden.
Pförtner meldet, dass die Anwendung beschädigt ist und verhindert, dass ApE vom Laufen.
Sie müssen die Systemeinstellungen> Sicherheit und Datenschutz> Allgemeine gehen.
Überprüfen Sie „Erlauben Software von überall heruntergeladen“ zu ermöglichen ApE auszuführen.
Appearntly der rechten Maustaste auf ApE und wählen Sie „Öffnen“ nicht Torwächter arbeiten auf allen Systemen zu umgehen.
Oder eine Befehlszeilenfunktion verwenden, um die Quarantäne-Attribute zu ändern.
- Text Karte zeigt DNA-Sequenz, Translation und verfügt als textbasierte Grafiken
- Virtuelle Restriktionsverdau
- Zeichnet vordefinierte und benutzerdefinierte DNA-Leitern
- Verbindet Bands Text durch Doppelklick
- Liest ABI-Sequenzierungs Trace-Dateien
- Sequenzen in ABI Spuren können direkt zu einer Referenzsequenz ausgerichtet werden, wobei die Ausrichtung zurück te Spur hyperlinked.
Andere Eigenschaften:
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Sie können nun direkt genomischen Regionen von WormBase exportieren: In der rechten oberen Dropdown-Menü-Taste, wählen Sie „Track herunterladen Data“. Klicken Sie auf „Konfigurieren.“ -Taste. Dump ausgewählte Features mit Version 3 Quer durch derzeit sichtbaren Bereich. Check „In Datei speichern“. Check "einbetten DNA-Sequenz". UNCHECK „Include Konfigurationsdatenspur“. Klicken Sie auf "Go". Öffnen Sie die resultierende .gff Datei im aktuellen ApE.
Alternativ können Sie auch eine genomische Region (aus dem Genom-Viewer) als FASTA formatierte Datei (mit dem Menü oben links) exportieren. Sie können durch Herunterladen der GFF3 Feature Track-Dateien mit dem gleichen Menü die Funktion Spuren hinzufügen. In ApE, öffnen Sie die FASTA-Datei, dann auf das Menü Funktionen verwenden, um die GFF3 Track-Informationen zu öffnen.
Ein anderer Weg zu gehen, ist das Gen-Modell zu nehmen (von Gen-Seite), fügen Sie ihn in ein Menschenaffe Fenster und dann alle wählen, ein neues Feature (Feature-Menü) machen, und in der Bearbeitungsfunktion angezeigten Fenster drücken Sie die „obere Gehäuse nur“-Taste.
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